学校1956年设立体育教研室，2003年提升为体育部，2006年成立体育健康学院。

学院目前下设党政办公室、学生工作办公室、学科科研办公室、竞赛中心、体测中心、三大球教研室、小球教研室、田径游泳教研室、传统保健体育与体操教研室、运动医学教研室等部门。

学院现有教职工49人，其中专任教师39人，含教授4人、副教授12人。教师队伍中，拥有世界冠军3名、国际健将2名、运动健将9名、一级运动员6名；国际级裁判1名、国家级裁判5名、一级裁判5名。

学院坚持“以本为本”，将本科教学作为中心工作，不断优化人才培养方案，加强课程思政建设，提升教学质量。同时，学院还注重实践教学和创新创业教育，积极培养学生的实践能力和创新精神。体育教育专业年均招生约120—130人，近五年本科毕业生就业去向落实率达99.0%。

2010年，学院获批“运动医学”硕士点，着力培养掌握中医药、运动医学及体育学科基础理论和系统深入的专业知识，具备从事运动医学科学研究、运动损伤研究、运动康复实践和教育工作能力的高层次专门人才。运动医学专业现有硕士研究生导师8名，年均招生约10人，近五年研究生就业去向落实率达97.5%。

2020年，学院获批广东省科技厅“广东省武术文化科普基地”、广东省教育厅“广东省八段锦传承基地”。2021年，学院入选广东省学生体育艺术联合会理事单位。同年，以学院为主要依托单位建设的数字中医药文化研究与传播创新重点实验室，获广东省哲学社会科学规划办立项，为全省首批5家省级哲学社会科学重点实验室之一。2022年，获评广东省学生体育艺术联合会武术分会会长单位。2023年，获批广州市社科联“智慧中医・体医融合健康文化研究与体验基地”。2025年，获评广东省红十字会应急救护健康科普培训中心。